Nace el 15 de mayo de 1944 en la Ciudad de México. Como jugador formó parte de los equipos Monterrey, Necaxa, Puebla y Atlas.

Su trayectoria como entrenador es una de las más ricas en cuanto a historia y triunfos. Manuel Lapuente debutó como director técnico hace treinta y dos años y desde el torneo 1978-1979 ha dirigido siete equipos en su carrera: Puebla, Tigres, Ángeles, Atlante, Cruz Azul, Necaxa y América.

Ha sido campeón de liga en cinco ocasiones; con Puebla en la temporada 82-83 y en la 89-90, con Necaxa en la 94-95 y 95-96 y con América en el Verano 2002.

Como seleccionador nacional, ha dirigido al equipo en dos etapas, la primera de 1990 a 1991 y una segunda de 1997 al 2000. Fue mundialista en Francia 1998 y Campeón de la Copa Confederaciones en 1999.